Szczury przenoszą choroby od początku istnienia gatunku. Zagrażają zapasom, zanieczyszczają je wydzielinami, moczem oraz kałem. Co w niejednokrotnie prowadziło do zniszczenia zapasów. Z uwagi na częste bytowania szczurów w kanalizacji oraz ściekach czy wysypiskach, należy dezynfekować czyste miejsca w których się pojawiają. Szczury nie atakują człowieka chyba że same zostaną zaatakowane, ugryzienie może skończyć się bardzo źle, po ugryzieniu przez szczura mogą pojawić się, dur brzuszny (ostra choroba zakaźna), dżuma (ostra bakteryjna choroba zakaźna) pchły, wszy, tularemia, wścieklizna, salmonella, leptospiroza(Choroba zakaźna). Ważne że część chorób powoduje nie tylko ugryzienie szczura a również kontakt z odchodami oraz moczem.